Alternance - Ingénieur en Traitement d'Images Sous-Marines H/F - Ifremer

Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète

Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.

L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.

Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.

www.ifremer.fr

Date limite de dépôt des candidatures : le 28/06/2026 (CV et lettre de motivation en un seul document)

L'une des deux unités décrites ci-dessous vous accueillera en fonction du lieu géographique de votre organisme de formation.

L'unité Ifremer intégrée dans l'UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitaion and Conservation) basé à Sète (34), mène des travaux de recherche sur la biodiversité marine, ses usages et sa conservation, plus particulièrement en écologie halieutique et en aquacultures durables. Les actions du laboratoire Halieutique Méditerranée (LHM), qui est l'une des composantes de cette unité, se développent dans trois domaines complémentaires : (i) dynamique des populations et des flottilles pour les principales espèces de poisson exploitées, (ii) écologie halieutique et interactions trophiques et (iii) écologie d'espèces marines menacées et interactions avec la pêche.

L'unité mixte de recherche (UMR) "Dynamique et durabilité des écosystèmes : de la source à l'océan" (DECOD) regroupe des chercheurs, ingénieurs et techniciens de Ifremer (unité Halieutique Grand Ouest HALGO), de l'INRAE et de l'Institut Agro Rennes-Angers avec des laboratoires à Brest, Lorient, Nantes et Rennes (https://www.umr-decod.fr). Les activités de DECOD portent sur l'analyse des processus écologiques et évolutifs à l'oeuvre dans les milieux aquatiques et leurs interfaces, de la source à l'océan, sur l'évaluation de l'état des écosystèmes et sur la construction de scénarios pour ces écosystèmes. Pour répondre à ces questions, le Laboratoire de Technologie et Biologie Halieutique (LTBH - unité HALGO) de Lorient acquiert des connaissances :sur les organismes marins exploités, de l'échelle individuelle à celle de la population, et met en oeuvre des modèles et des approches quantitatives basées sur des données empiriques, dans le cadre d'une approche écosystémique des pêches. L'un des axes de travail spécifique du laboratoire est la réduction de l'impact des engins de pêche sur les écosystèmes marins.

Introduction du poste à pourvoir et de sa position dans l'organigramme

Cette dernière décennie, l'imagerie sous-marine est devenue un outil incontournable pour l'évaluation de la biodiversité et le suivi des écosystèmes marins. Cet essor a notamment été possible grâce à l'augmentation exponentielle de la résolution et de la qualité des capteurs optiques, accompagnée d'une diminution de leur coût, facilitant leur acquisition. Cette approche, non destructive, permet l'étude de la distribution des habitats et des espèces marines sur des échelles de temps et d'espace sans précédent. Ainsi, les études basées sur l'imagerie sous-marine ont pris une place importante au sein de l'institut puisque son utilisation couvre plusieurs départements et métiers. L'essor de l'imagerie entraîne cependant de nouvelles problématiques, en particulier celles liées à l'ère des méga-données, incluant le traitement du volume colossal de données mais également sa bancarisation et son archivage. Les données optiques incluent images et vidéos provenant d'un grand nombre de systèmes d'acquisition.

L'avènement de l'Intelligence Artificielle (IA) a permis le développement d'algorithmes puissants qui peuvent faciliter le traitement de ces méga-données. Cependant la capacité des machines à transformer ces volumes de signaux bruts (ici optiques) en données utilisables à des fins scientifiques est conditionnée par une phase d'apprentissage sur de larges bases de données de références, standardisées, issues dun traitement « manuel » par des experts humains. Faisant suite à des travaux réalisés notamment dans le cadre du Programme Prioritaire de Recherche Ocean et climat (PPR) FUTURE-OBS et Game of Trawls ayant permis de développer des bases de données d'imagerie benthique (des fonds marins) et des outils de traitement variés (Biigle, Viame, ...), vous poursuivrez les développements déjà réalisés dans ce domaine de façon à permettre une meilleure intégration et standardisation des flux de traitements d'imagerie optique benthique au sein des infrastructures existantes à Ifremer.

Vous serez positionné(e) au niveau du Département RBE. En fonction de votre choix d'implantation géographique, vous serez placé(e) sous la responsabilité des responsables de l'unité Marbec et du Laboratoire Halieutique Méditerranée ou de l'unité HALGO et du Laboratoire Technologie et Biologie Halieutique.

Quelle sera votre mission ?

Vous participerez, en collaboration avec les personnels utilisateurs d'imagerie benthique:

- à la prise en main des différents outils d'IA pour l'imagerie benthique à l'Ifremer
- à la rédaction d'une note de synthèse des outils disponibles pour l'imagerie benthique, avec une analyse AFOM de chaque outil
- à l'organisation et à la structuration des jeux de données d'annotations des nombreuses images disponibles, en vue notamment d'alimenter les bases d'apprentissage pour le développement d'outils de machine learning,
- à la prise en main et finalisation des outils passerelles (standardisation des formats de données) entre les outils disponibles
- à la mise en production d'outils de versionning déjà développés
- à l'intégration de modèles pré-entraînés dans les outils d'analyse d'image déjà en place.
- au développement de modules spécifiques qui s'intégreront dans les outils existants (ex détection de points ou lignes laser dans les images)
- au développement , à l'analyse et à la validation des résultats du deep-learning appliqués l'analyse d'images et de vidéos, en particulier dans le cadre d'évaluations de stocks ou d'état des habitats benthiques.

Bien qu'appliquer uniquement à l'imagerie benthique, les outils et approches seront suffisamment génériques pour être directement applicables sur d'autres domaines d'imagerie (poissons, aérien, captures accidentelles...).

Finalités de la fonction

. Concevoir et développer des suites logicielles et de flux de données pour le traitement d'images de fond marin à viser de suivi de la biodiversité et de gestion des ressources.

. Organiser et structurer des jeux de données d'annotations d'images disponibles, en vue notamment d'alimenter des bases d'apprentissage.

. Participer au développement des outils de deep learning en interaction avec des initiatives existantes à Ifremer ou dans le cadre de collaboration européennes (i.e. Biigle : https://biigle.de, https://github.com/biigle, VIAME https://github.com/VIAME/VIAME, https://github.com/Kitware/dive) concernant des applications sur l'analyses d'images et de vidéos de fonds sous-marin.

. Concevoir des outils intégrés aux infrastructures du centre de calcul et données scientifiques de l' Ifremer (Calculateur Datarmor) et déployables en Mer pour traitement in situ.

Quelles seront vos activités ?

- Développer et optimiser les fonctionnalités, arbres décisionnels et interfaces graphiques

- Travailler en collaboration avec d'autres ingénieurs et chercheurs pour développer des solutions logicielles innovantes correspondantes aux besoins des utilisateurs

- Rédiger les documentations techniques et de suivi technique sur l'avancée du projet

- Faire de la Veille technologique

Vous recherchez un contrat d'apprentissage ou de professionnalisation d'une durée de 3 ans en suivant une formation dans une école d'ingénieur (IMT-Mines-Telecom, INSA, ENIB, Polytech, INP, IPSSI, EPITA , etc) ou un cursus universitaire (BUT puis Master sciences informatiques et IA).

Formation initiale et expériences professionnelles attendues :

Bac +2/3 en data science, data mining, math-informatique, mathématiques appliquées ou traitement d'images / algorithmie-informatique

Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes :

- Maitrise du développement C/C++/Python,/JAVA
- Connaissance/Maitrise des Framework classiques tels que OPENCV ou ITK/VTK
- Connaissance en traitement et analyse d'images optiques, en traitements vidéo et en géométrie et géoréférencement des capteurs image,
- Gestion et méthodes d'analyse de grands jeux de données (statistiques et data mining)
- Une culture des technologies Machine/Deep Learning (ex tensorflow) serait apprecié
- Bonne maîtrise de l'anglais technique

Les éléments suivants seront appréciés :

- Démontrer une expérience dans le développement de logiciels, par exemple un compte GitHub actif, des projets scolaires ou coopératifs réussis, ou des compétitions de programmation.

- Avoir documenté des contributions à des logiciels libres

Vous avez les qualités suivantes :

- Méthode et grande rigueur
- Autonomie
- Créativité et passion : vous savez mettre tous vos efforts au service de la résolution d'un problème ou du développement d'une solution innovante.
- Ouverture : vous savez travailler en équipe et collaborer avec les différents partenaires du projet ainsi qu'avec des entités extérieures au projet possédant des compétences particulières.
- Curiosité : vous êtes intéressé (e) par l'application de vos capacités à l'étude de la biodiversité marine en vue de sa gestion et préservation.